JTAG接口一般用到了下面4根线：
TMS——模式选择输入，在TCK的上升沿送入TAP控制器，用于状态的转换；
TDI——输入引脚，指令和数据通过它在TCK的上升沿送入TAP控制器；
TDO——输出引脚，数据在TCK的下降沿由此输出；
TCK——输入时钟，为TAP控制器的输入和输出提供时序控制。
TAP控制器含有1个指令寄存器和若干数据寄存器(数据扫描链)，对于Xilinx的可编程逻辑器件，其指令寄存器一般为8位。TAP控制器的工作流程是，通过TMS引脚，使状态机按照图3所示的转换图处于某一状态下，送入特定的指令，TAP控制器对指令进行译码，译码结果将产生相关动作，例如选择一条数据扫描链准备接收数据，或捕获功能引脚信号到数据寄存器等。